Empezó con el hecho de que una dama inglesa, de apellido McDonald, llevó al Reino Unido una planta estéril, la que floreció en al año de 1845 en el vivero del señor Edward St Vincent Digby (1794-1864), de Mintern en Dorset, Inglaterra; de allí el nombre del epíteto digbyana.
El primer nombre científico de la Flor Nacional le fue dado en 1846 por el botánico inglés John Lindley (1799-1865) quien la llamó Brassavola digbyana y la publicó con una ilustración, la número 53, en el libro Edwards’s Botanical Register. El nombre del género Brassavola es en honor al botánico italiano de Venecia de nombre Antonio Musa Brassavola (1500-1555).
El botánico alemán, Heinrich Gustav Reichenbach, hijo, (1824-1889), consideró que la planta no era una Brassavola, sino una Bletia, y en consecuencia, trasladó la especie a ese género, y la Flor Nacional pasó a llamarse Bletia digbyana. El nuevo nombre lo publicó Reichenbach, hijo, en el año de 1862 en la revista Annales Botanicae Systematicae.
Sin embargo, para otro botánico inglés llamado George Bentham (1800-1884), la planta no pertenecía al género Brassavola sino al género Laelia y, en consecuencia, trasladó el epíteto a este género, y la Flor Nacional pasó a llamarse Laelia digbyana. Esta combinación nueva la publicó Bentham en el año de 1880 en la revista Journal of the Linnean Society, Botany de Inglaterra.
Un estudio más minucioso de la orquídea nacional de Honduras llevó al botánico alemán Friedrich Richard Rudolf Schlechter (1872-1925) a la conclusión de que no encajaba bien ninguno de los dos géneros y creó para ella uno nuevo al que llamó Rhyncholaelia, del griego rhynchos (trompa o pico), en alusión al fruto con un apéndice largo, y Laelia, un género de orquídeas muy parecido a Rhyncholaelia. Este traslado de la especie al género Rhyncholaelia lo publicó Schlechter en el año de 1918 en la revista alemana Beihefte zum Botanischen Centralblatt, y la Flor Nacional pasó a llamarse Rhyncholaelia digbyana.
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